除了一般既有的組織單位與機關，世界觀中較特殊的組織為研究所、管理局、醫療系統。

此頁面為基礎簡介，組織介紹的子頁面為補充材料，僅供需要的玩家參考。

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​精神離子研究所：

最了解精神離子的人們所集結的私人學術組織，在世界各地都有分部。

圍繞著企劃主題核心的組織。

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​管理局：​

針對各地CAPLS災害進行處理的國際聯合組織，亦有培訓使用心靈體戰鬥的特警。

倫理教育部門(心靈體犯罪處理與教育推廣)、特殊防制部門(針對CAPLS出沒進行部隊編纂)

管理局的特殊防制部門與研究所的災害防治部門為關係密切的單位。

精神離子醫療系：

各地醫院中備有的新興系別，救死扶傷的醫療單位。

長期照護(針對因精神離子濃度過低而腦死的患者)、PI治療(協助恢復精神離子達到正常濃度)

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三方在世界觀中都具有互助與合作性質，但組織運行各自獨立，沒有隸屬關係。

​也沒有完全共享情報和秘密的義務。

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